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实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技术,简称qPCR。与普通PCR技术相比,实时荧光定量PCR技术是一次由定性技术向定量技术的进步,可以对DNA、RNA样品进行定量分析。
qPCR技术是在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光标记的特异性探针,使用荧光信号积累从而实时反应整个PCR进程,最终通过标准曲线模板对未知样本检测结果进行定量分析的一个进程。
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)实验流程可分为:①样本采集→②RNA提取→③RNA质量鉴定→④反转录成cDNA→⑤PCR扩增→⑥数据分析。
对应操作流程中纯水的应用:
qPCR实验用水要求
qPCR实验推荐使用的超纯水水质要求:
电阻率:18.2MΩ·cm@25℃;
TOC:<5ppb;
微生物:<0.01cfu/ml;
DNAse &RNAse:无。
在上述实验流程中,引物稀释、Buffer稀释和配置、补足反应体系等都会用到纯水,纯水的水质将直接影响最终数据分析实验结果的准确率。
水中的有机物、离子含量、微生物、颗粒物等杂质都会给实验带来影响,一般qPCR实验中的纯水应用会更加关注以下两种指标。
一、DNA酶&RNA酶
DNA酶和RNA酶一般指DNA水解酶与RNA水解酶,DNA酶可使DNA主链上的磷酸二酯键水解,而RNA酶可作用于RNA的脱氧核糖核酸之间的连接键,二者的左右都会造成DNA和RNA水解,会直接影响实验的最终结果。
在进行qPCR实验时,保证提取的RNA和DNA样本的完整性十分关键,尤其在提取RNA的时候,RNA极易被降解,所以去除这两种酶也成为了保证qPCR实验的关键。如果样本中的核酸被降解,会影响检测结果的准确性,容易造成假阴性检测结果,如在新冠病毒的核酸检测过程中出现假阴性,可能会对疫情防控带来不可控的隐患。
因此,qPCR实验的实验用水必须有效降低DNA酶和RNA酶的含量,以减少对实验结果的影响。
二、镁离子
qPCR实验中,针对不同的引物和相应的模板,需要确定合适的镁离子浓度。
如果镁离子浓度过高,会增加引物二聚体的形成,直接影响特异性。如果镁离子浓度过低,则会影响DNA聚合酶的活性,导致产量降低,影响实时定量的敏感性。
所以qPCR实验中使用的超纯水必须控制镁离子浓度,从而避免背景因素所带来的不可控因素。
超纯水系统选型推荐
依据实验原理及用水指标,推荐使用力康新款Smart Plus超纯水系统,能满足用户在qPCR实验过程中的用水需求。
Smart Plus系列是Heal Force新一代超纯水系统,能够以自来水为进水制备分析纯水和超纯水,或直接以RO水、蒸馏水为进水制备超纯水,力康Smart Plus系列超纯水机是Smart系列的全面升级。
Smart Plus 超纯水系统
力康超纯水系统
解决方案优势
1、Smart Plus NET超纯水机可实时检测超纯水TOC指标,内置力康自主研发的EDI模块,使用连续电流去离子技术不断去除离子与其它带电物质,从而保障超纯水的水质稳定。该款超纯水机高效的去离子效果可以广谱去除水中的金属离子,大幅降低实验用水中镁离子对qPCR实验的干扰,并且连续电流可不断再生树脂,可有效降低因更换超纯柱所带来的高昂成本。
2、Smart Plus NET&Smart Plus P两款超纯水机均可配置生物型终端过滤器,可有效去除DNA酶和RNA酶,避免核酸酶对实验的影响。
3、大型核酸基地、医院检验科等应用场景,通常需要大量的实验用水,为各qPCR设备单独配备超纯水系统会使用户成本提高,力康Pureforce ROE中央供水系统可提供稳定的高纯水中央供水,通过在终端取水点配备Smart Plus PT超纯水机,可以以纯水作为进水产出超纯水,从而降低用户成本。
力康qPCR实验用水解决方案可以降低超纯水对qPCR反应的不确定性,更好地满足qPCR实验的用水要求,为您带来更满意的实验体验。
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